NEJM:张锋团队发布简易CRISPR新冠检测2.0版,提高检测灵敏度
▎药明康德内容团队编辑
2.0版的STOPCovid在原有检测的基础上更进一步,在样本制备的过程中通过加入磁珠富集样本中的RNA,从而通过提高PCR反应的起始RNA数量,进一步提高了STOPCovid.V2的检测灵敏度。
在最初的STOPCovid检测流程中,张锋团队将扩增RNA数目的等温PCR步骤和使用Cas酶检测新冠病毒特定序列的化学反应合并在同一个试管中进行。这一检测步骤不需要复杂仪器,只需要在60摄氏度的恒温反应,就可以通过侧流试纸读出检测结果。然而,在进一步检测中,研究人员发现,这一简易版流程只能发现60.5%传统RT-PCR检测出的阳性患者。
为了提高检测的灵敏度,STOPCovid.v2的流程中加入了通过磁珠富集鼻咽拭子中新冠病毒RNA的步骤,使用普通实验室中用于富集RNA的磁珠,研究人员可以收集鼻咽拭子中包含的所有病毒RNA作为反应的起始材料,而且研究人员同时精简了磁珠富集RNA的操作步骤,去除了乙醇清洗和洗脱过程,让整个RNA富集过程不超过15分钟。
▲STOPCovid.V2的操作流程(图片来源:参考资料[1])
在华盛顿大学进行的一项设盲检测中,研究人员检测了STOPCovid.V2检验202个新冠病毒阳性和200个新冠病毒阴性鼻咽拭子样本的结果。研究人员发现,STOPCovid.V2能够达到93.1%的灵敏度和98.5%的特异性。阳性样本只需15-45分钟就能获得结果。
▲STOPCovid.V2的检测结果,B:新冠病毒阳性样本;C:新冠病毒阴性样本,红色虚线为判断样本为阳性还是阴性的阈值(图片来源:参考资料[1])
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参考资料:
[1] Joung et al, (2020). Detection of SARS-CoV-2 with SHERLOCK One-Pot Testing. NEJM, DOI: 10.1056/NEJMc2026172
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